Logistic Regression in R - Predicting diabetes risk

Definition

Logistic regression is a statistical analysis method to predict a binary outcome, such as yes or no, based on prior observations of a data set. A logistic regression model predicts a dependent data variable by analyzing the relationship between one or more existing independent variables. For example, in health, Logistic regression can also be used in the following areas: • To identify risk factors and plan preventive measures; • In drug research to tease apart the effectiveness of medicines on health outcomes across age, gender and ethnicity;

About the project

I used data of 318 individuals with and without diabetes type 2.The aim is to examine the relationship between age, gender, BMI, diet type, smoking status and family history of disease and build a model for predicting diabetes risk

Importing data into R and loading packages

Code

Diabetes <- read.csv("diabetes.csv")
if(!require(pacman)) install.packages("pacman")

Le chargement a nécessité le package : pacman

Code

## Loading required package: pacman
pacman::p_load( tidyverse, janitor, plotrix, gtsummary, survival )

Installation du package dans 'C:/Users/asus/AppData/Local/R/win-library/4.4'
(car 'lib' n'est pas spécifié)

Warning: impossible d'accéder à l'index de l'entrepôt http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/4.4:
  impossible d'ouvrir l'URL 'http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/4.4/PACKAGES'

le package 'janitor' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés

Les packages binaires téléchargés sont dans
    C:\Users\asus\AppData\Local\Temp\RtmpYXAxW8\downloaded_packages


janitor installed

Installation du package dans 'C:/Users/asus/AppData/Local/R/win-library/4.4'
(car 'lib' n'est pas spécifié)

Warning: impossible d'accéder à l'index de l'entrepôt http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/4.4:
  impossible d'ouvrir l'URL 'http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/4.4/PACKAGES'

le package 'plotrix' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés

Les packages binaires téléchargés sont dans
    C:\Users\asus\AppData\Local\Temp\RtmpYXAxW8\downloaded_packages


plotrix installed
Installation du package dans 'C:/Users/asus/AppData/Local/R/win-library/4.4'
(car 'lib' n'est pas spécifié)

installation des dépendances 'V8', 'reactR', 'bigD', 'juicyjuice', 'reactable', 'cards', 'glue', 'gt'

Warning: impossible d'accéder à l'index de l'entrepôt http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/4.4:
  impossible d'ouvrir l'URL 'http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/4.4/PACKAGES'

le package 'V8' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés
le package 'reactR' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés
le package 'bigD' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés
le package 'juicyjuice' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés
le package 'reactable' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés
le package 'cards' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés
le package 'glue' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés

Warning: impossible de supprimer l'installation précédente du package 'glue'

Warning in file.copy(savedcopy, lib, recursive = TRUE): problème lors de la
copie de
C:\Users\asus\AppData\Local\R\win-library\4.4\00LOCK\glue\libs\x64\glue.dll
vers C:\Users\asus\AppData\Local\R\win-library\4.4\glue\libs\x64\glue.dll :
Permission denied

Warning: 'glue' restauré

le package 'gt' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés
le package 'gtsummary' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés

Les packages binaires téléchargés sont dans
    C:\Users\asus\AppData\Local\Temp\RtmpYXAxW8\downloaded_packages


gtsummary installed

Warning in pacman::p_load(tidyverse, janitor, plotrix, gtsummary, survival): Failed to install/load:
gtsummary